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La participation des citoyens aux décisions qui tranchent des débats Science Société reste marginale. Les occasions sont rares et elles bénéficient d'une promotion bien trop discrète. Dans ce contexte, le site Débats Science Société s'est donné pour mission de promouvoir cette participation citoyenne :
L'idée directrice de ce projet est qu'un auditoire mieux préparé doit permettre un débat plus productif. Elle n'est cependant pas originale puisqu'elle constitue aussi l'un des principes fondateurs des récentes Conférences de Citoyens. Malheureusement, ces dernières n'ont permis de former qu'une quinzaine de citoyens à chaque fois. En utilisant le web comme moyen de diffusion et le multimedia comme support pédagogique, le site Débats Science Société souhaite étendre cette démarche.